Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSBP2P81877 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SSBP2P81877 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SSBP2P81877 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP2P81877 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP2P81877 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP2P81877 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP2P81877 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP2P81877 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SSBP2P81877 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSBP2P81877 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms