Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IL13RA1P78552 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IL13RA1P78552 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms