Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PIP4K2BP78356 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PIP4K2BP78356 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms