Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNRPNP63162 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPNP63162 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms