Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RAB1AP62820 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms