Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARF6P62330 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ARF6P62330 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ARF6P62330 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms