Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UFM1P61960 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UFM1P61960 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UFM1P61960 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UFM1P61960 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UFM1P61960 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
UFM1P61960 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UFM1P61960 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UFM1P61960 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UFM1P61960 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UFM1P61960 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UFM1P61960 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UFM1P61960 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms