Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms