Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
LINC01547P58512 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
LINC01547P58512 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms