Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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FAM3BP58499 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM3BP58499 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM3BP58499 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM3BP58499 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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