Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms