Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LOXL3P58215 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms