Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ELLP55199 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ELLP55199 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ELLP55199 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms