Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBX2P52951 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GBX2P52951 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GBX2P52951 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GBX2P52951 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms