Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GTF2A2P52657 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2A2P52657 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms