Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NUP153P49790 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NUP153P49790 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NUP153P49790 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP153P49790 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP153P49790 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NUP153P49790 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NUP153P49790 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms