Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UTRNP46939 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UTRNP46939 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
UTRNP46939 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UTRNP46939 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UTRNP46939 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UTRNP46939 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms