Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNPDA1P46926 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms