Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ACADSBP45954 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms