Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTGDSP41222 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PTGDSP41222 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms