Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FDFT1P37268 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FDFT1P37268 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms