Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TGFBR1P36897 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms