Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRNA7P36544 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms