Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTNNB1P35222 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms