Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA4P34932 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms