Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCKBRP32239 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 813.3 ms