Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HOXC13P31276 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms