Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LOXP28300 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LOXP28300 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LOXP28300 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXP28300 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXP28300 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXP28300 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXP28300 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms