Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TNFSF4P23510 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TNFSF4P23510 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms