Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRGP23470 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRGP23470 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
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