Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRHP20396 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRHP20396 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRHP20396 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRHP20396 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRHP20396 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRHP20396 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TRHP20396 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRHP20396 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRHP20396 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRHP20396 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRHP20396 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRHP20396 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRHP20396 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRHP20396 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRHP20396 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRHP20396 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRHP20396 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRHP20396 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRHP20396 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRHP20396 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRHP20396 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRHP20396 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRHP20396 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRHP20396 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TRHP20396 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRHP20396 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRHP20396 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms