Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCLP19338 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCLP19338 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCLP19338 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCLP19338 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCLP19338 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCLP19338 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCLP19338 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NCLP19338 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NCLP19338 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NCLP19338 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms