Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRAP18433 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRAP18433 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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