Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXB4P17483 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms