Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HLA-DOBP13765 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms