Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RLBP1P12271 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RLBP1P12271 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms