Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VSIG8P0DPA2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms