Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PKHD1P08F94 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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