Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HSP90AB1P08238 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HSP90AB1P08238 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms