Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCCAP05165 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCCAP05165 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PCCAP05165 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCCAP05165 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCCAP05165 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCCAP05165 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCCAP05165 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCCAP05165 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCCAP05165 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCCAP05165 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms