Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGAP02671 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGAP02671 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGAP02671 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGAP02671 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGAP02671 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms