Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IFNA2P01563 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms