Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPFIA3O75145 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPFIA3O75145 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms