Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC22O60826 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms