Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAK2O60296 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAK2O60296 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms