Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM8AO60220 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TIMM8AO60220 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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