Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX6O43752 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX6O43752 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
STX6O43752 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STX6O43752 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STX6O43752 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STX6O43752 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STX6O43752 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STX6O43752 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STX6O43752 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms