Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPAA1O43292 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GPAA1O43292 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms