Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MCRIP1C9JLW8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms