Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VGLL3A8MV65 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VGLL3A8MV65 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms